Setelah tak lagi menjabat sebagai pejabat publik, pada tahun 2020, Jonan menerima jabatan sebagai Komisaris Independen di PT Unilever Indonesia. Di tahun yang sama, dia juga sempat ditunjuk dengan jabatan serupa di Sido Muncul, tetapi mengundurkan diri pada Januari 2021.
Pada Juni 2021, dia ditunjuk sebagai Komisaris Utama merangkap Komisaris Independen PT Anabatic Tbk, perusahaan yang bergerak di bidang teknologi informasi, komputer, hingga pengolahan data. Setahun setelahnya, mulai 2022, perusahaan pialang asuransi dan pengelolaan risiko terkait asuransi, PT Marsh Indonesia, menunjuk Ignasius Jonan sebagai Presiden Komisaris.
Hingga kini, Jonan menjabat sebagai Komisaris Independen di PT Unilever Indonesia; Komisaris Utama sekaligus Komisaris Independen PT Anabatic Tbk; serta Presiden Komisaris PT Marsh Indonesia.
Siap Menyambut Kedatangan Paus Fransiskus ke Indonesia
Pada September 2024 mendatang, lebih tepatnya pada tanggal 3 hingga 6 September, Paus Fransiskus dijadwalkan melakukan kunjungan kenegaraan ke Indonesia. Dalam kesempatan tersebut, Ignasius Jonan dipercaya menjadi Ketua Panitia Pelaksana Kunjungan Paus Fransiskus ke Indonesia.